31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0442 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0442  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  183  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836978  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0367  hypothetical protein  62.22 
 
 
95 aa  98.6  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0286691 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3805  protein of unknown function DUF1471  58.9 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4659  hypothetical protein  58.9 
 
 
95 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.642992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3825  hypothetical protein  58.9 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4748  hypothetical protein  58.9 
 
 
95 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.644258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4432  hypothetical protein  58.9 
 
 
95 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5704  hypothetical protein  58.9 
 
 
95 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04017  hypothetical protein  58.9 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04055  hypothetical protein  58.9 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4718  hypothetical protein  57.53 
 
 
95 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4775  hypothetical protein  57.75 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4656  protein YjfN  57.75 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4646  protein YjfN  57.75 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4796  hypothetical protein  57.75 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329964  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4739  hypothetical protein  57.75 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  33.33 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  29.41 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0771  putative biofilm stress and motility protein A  41.67 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0137672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  31.71 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  28.24 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  29.11 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  29.11 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  29.11 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3787  putative biofilm stress and motility protein A  30.11 
 
 
103 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3642  putative biofilm stress and motility protein A  30.11 
 
 
103 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  31.71 
 
 
87 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  31.71 
 
 
87 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  31.71 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  31.71 
 
 
87 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0443  putative biofilm stress and motility protein A  50 
 
 
102 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>