43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1592 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  83.33 
 
 		 262 aa  428  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  80.47 
 
 		 255 aa  417  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  81.23 
 
 		 263 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  83.87 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  72.09 
 
 		 261 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  68.46 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  67.17 
 
 		 264 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  60.15 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  54.07 
 
 		 495 aa  249  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  53.57 
 
 		 503 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  52.78 
 
 		 506 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  51.95 
 
 		 503 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  49.6 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  47.1 
 
 		 244 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  45.91 
 
 		 245 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  50.21 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  45.56 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  42.86 
 
 		 244 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  46.12 
 
 		 244 aa  198  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  43.63 
 
 		 244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  45.74 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  38.87 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  38.77 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  35.97 
 
 		 497 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  35.15 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  32.42 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  36.75 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  32.6 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  31.2 
 
 		 601 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  32.77 
 
 		 230 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  31.67 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  31.3 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  26.64 
 
 		 497 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  29.22 
 
 		 508 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  28.4 
 
 		 620 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  27.42 
 
 		 507 aa  99.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  31.71 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  27.62 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  34.39 
 
 		 646 aa  89  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  31.42 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  26.36 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  25.23 
 
 		 481 aa  75.9  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>