43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1591 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  90.16 
 
 		 244 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  84.43 
 
 		 245 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  85.25 
 
 		 244 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  87.24 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  72.61 
 
 		 244 aa  351  8e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  68.64 
 
 		 245 aa  322  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  74.49 
 
 		 244 aa  318  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  65.81 
 
 		 248 aa  285  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  48.97 
 
 		 495 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  50.42 
 
 		 506 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  44.49 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  43.8 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  46.09 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  43.19 
 
 		 262 aa  205  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  46.09 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  43.02 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  46.09 
 
 		 503 aa  201  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  47.16 
 
 		 503 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  44.96 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  41.88 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  42.06 
 
 		 278 aa  191  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  43.65 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  38.68 
 
 		 497 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  38.93 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  34.31 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  35.17 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  34.6 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  33.48 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  34.62 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  36.36 
 
 		 601 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  31.38 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  31.72 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  30.54 
 
 		 507 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  31.51 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  34.05 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  30.64 
 
 		 620 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  31.93 
 
 		 497 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  32.02 
 
 		 508 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  32.65 
 
 		 646 aa  99.8  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  31.74 
 
 		 288 aa  95.1  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  29.36 
 
 		 545 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  27.54 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>