12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6417 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  38.14 
 
 
583 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 
599 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  35.77 
 
 
576 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 
515 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 
609 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  25 
 
 
587 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  27.44 
 
 
596 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  25.65 
 
 
560 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
618 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  38.89 
 
 
636 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  32.14 
 
 
688 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>