19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5024 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  237  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  61.26 
 
 
126 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  59.82 
 
 
154 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  58.93 
 
 
121 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  59.29 
 
 
129 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  59.63 
 
 
122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  61.32 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  61.26 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  54.7 
 
 
118 aa  127  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0585  hypothetical protein  69.39 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1364  hypothetical protein  39.29 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.703874  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1204  hypothetical protein  39.29 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  0.100074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1143  hypothetical protein  38.39 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3776  hypothetical protein  35.09 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2283  hypothetical protein  35.78 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  33.06 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  46.43 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  29.27 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  29.84 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>