13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3673 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3673  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  679    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.141443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6116  hypothetical protein  38.27 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3035  hypothetical protein  30.4 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2839  hypothetical protein  23.99 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.240505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.45 
 
 		 450 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.69 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3239  hypothetical protein  26.38 
 
 		 364 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0144295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  27.59 
 
 		 717 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  26.72 
 
 		 434 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  25.54 
 
 		 434 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.98 
 
 		 605 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1042 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  32.89 
 
 		 1111 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>