15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2454 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  100 
 
 
767 aa  1523    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  38.5 
 
 
756 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  30.91 
 
 
199 aa  91.7  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  39.52 
 
 
280 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  30.29 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  29.55 
 
 
183 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  34.43 
 
 
221 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.577822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  31.03 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1765  hypothetical protein  34.15 
 
 
240 aa  60.1  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.97626  normal  0.455491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  25.6 
 
 
203 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0783  Lanthionine synthetase C family protein  28.29 
 
 
1074 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265394  normal  0.258057 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1944  hypothetical protein  31.41 
 
 
191 aa  52  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  25.81 
 
 
196 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  27.69 
 
 
343 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2021  hypothetical protein  30.77 
 
 
191 aa  47.8  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>