20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0359 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0359  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  219  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3246  hypothetical protein  51.49 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0933  hypothetical protein  39.62 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0043  ketosteroid isomerase-like protein  29.91 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0379444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3489  hypothetical protein  32.08 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.695111 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6403  hypothetical protein  27.36 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.298397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0883  hypothetical protein  30 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949761  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0349  hypothetical protein  30.28 
 
 
109 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2171  hypothetical protein  34.74 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1957  hypothetical protein  31.25 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4369  hypothetical protein  31.13 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820627  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1485  hypothetical protein  29.81 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3997  hypothetical protein  31.13 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103649  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2028  hypothetical protein  29.13 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0739  hypothetical protein  29.13 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3526  hypothetical protein  30.19 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.510354 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6108  hypothetical protein  25.47 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2807  hypothetical protein  35.53 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.249118  normal  0.281052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4239  hypothetical protein  25.96 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157952  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2803  hypothetical protein  43.75 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.459087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>