263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5896 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5896  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  100 
 
 
341 aa  690    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183484  normal  0.734335 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4544  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  76.54 
 
 
341 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5843  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  71.85 
 
 
341 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302205  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6755  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  70.67 
 
 
341 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5393  ABC transporter substrate binding protein (sulfate)  69.18 
 
 
338 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0845321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  68.49 
 
 
335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  61.29 
 
 
354 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2077  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.92 
 
 
341 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000402733  hitchhiker  0.00000000000000351214 
 
 
-
 
NC_004310  BR0107  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  62.68 
 
 
342 aa  424  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0120  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.33 
 
 
342 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  64.29 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  63.81 
 
 
332 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3861  sulfate/molybdate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  64.52 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  63.17 
 
 
332 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4179  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.19 
 
 
334 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354274  normal  0.159883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  64.71 
 
 
365 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  63.99 
 
 
798 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.87 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  64.94 
 
 
807 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.43 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  64.31 
 
 
332 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0618  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.4 
 
 
339 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0236749  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  63.99 
 
 
328 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0698  ABC transporter sulfate binding protein  63.4 
 
 
339 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.72 
 
 
332 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3757  hypothetical protein  62.21 
 
 
322 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.63 
 
 
337 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  61.9 
 
 
330 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1044  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.2 
 
 
336 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4344  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.01 
 
 
328 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0989658  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.54 
 
 
359 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.06 
 
 
337 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  63.41 
 
 
336 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  62.19 
 
 
337 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0794  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.56 
 
 
335 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.01 
 
 
356 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0581  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.4 
 
 
355 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105531  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0592  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.69 
 
 
355 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.347338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.9 
 
 
336 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0084  extracellular solute-binding protein  62.5 
 
 
336 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  63.78 
 
 
335 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  61.54 
 
 
337 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0556  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.31 
 
 
349 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  59.82 
 
 
336 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.24 
 
 
339 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.63 
 
 
343 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2803  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.43 
 
 
336 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2246  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.71 
 
 
349 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.24 
 
 
339 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.28 
 
 
336 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  60.42 
 
 
335 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.83 
 
 
329 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.23 
 
 
329 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0308  sulfate-binding protein  60.87 
 
 
338 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  59.49 
 
 
346 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4554  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.98 
 
 
350 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  61.24 
 
 
329 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.24 
 
 
329 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  61.89 
 
 
329 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  62.21 
 
 
329 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.84 
 
 
341 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.13 
 
 
331 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  60.91 
 
 
329 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  61.24 
 
 
329 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  61.46 
 
 
327 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  61.24 
 
 
329 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.01 
 
 
337 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  60.91 
 
 
329 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  61.24 
 
 
329 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  61.24 
 
 
329 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  61.24 
 
 
329 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  61.56 
 
 
329 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1572  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.19 
 
 
344 aa  371  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  61.24 
 
 
329 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.31 
 
 
335 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.64 
 
 
338 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  61.24 
 
 
329 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  59.59 
 
 
329 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5231  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.62 
 
 
335 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297946  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.55 
 
 
345 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  61.24 
 
 
329 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5171  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60 
 
 
342 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138843  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5078  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60 
 
 
335 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151813  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.63 
 
 
345 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.26 
 
 
351 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.95 
 
 
345 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  57.27 
 
 
329 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  60.95 
 
 
345 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.95 
 
 
345 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  59.34 
 
 
329 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1196  sulfate ABC transporter, sulfate/thiosulfate-binding protein  60.59 
 
 
351 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  59.93 
 
 
351 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4739  thiosulphate-binding protein  60.32 
 
 
345 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623695  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4641  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.93 
 
 
340 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.869357  hitchhiker  0.00000640821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2981  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.58 
 
 
345 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  60.51 
 
 
329 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1773  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.81 
 
 
346 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4087  hypothetical protein  63.23 
 
 
289 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0732024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.69 
 
 
345 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0090  sulfate transporter subunit  59.87 
 
 
329 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>