204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5733 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5733  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 172 aa  353  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  45.78 
 
 		 893 aa  154  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1424  GCN5-related N-acetyltransferase  44.38 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 		 897 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 		 907 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 		 907 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 907 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  35.9 
 
 		 897 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 		 899 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 906 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4638  CoA-binding domain protein  35.48 
 
 		 907 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  36.97 
 
 		 902 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2589  CoA-binding domain-containing protein  34.59 
 
 		 918 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7760  putative Acetyl-CoA synthetase  34.46 
 
 		 903 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.0277308 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  35.66 
 
 		 877 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 		 893 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 		 900 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 900 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 900 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2463  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0279306  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3232  acetyltransferase  30 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 		 882 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 882 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  33.09 
 
 		 880 aa  80.9  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  33.09 
 
 		 880 aa  80.9  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 891 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.680583  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 		 880 aa  80.9  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  30.25 
 
 		 893 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  31.47 
 
 		 877 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 		 882 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 903 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  29.86 
 
 		 636 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 		 887 aa  78.6  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 		 887 aa  78.2  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  29.41 
 
 		 886 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 		 888 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.41 
 
 		 886 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  29.41 
 
 		 886 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.41 
 
 		 886 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  29.41 
 
 		 886 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 		 886 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  29.68 
 
 		 886 aa  75.1  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.68 
 
 		 886 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.68 
 
 		 886 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  29.68 
 
 		 886 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 		 886 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  29.68 
 
 		 886 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.68 
 
 		 886 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  29.68 
 
 		 886 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 893 aa  74.7  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4289  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 		 807 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6923  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 834 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  27.27 
 
 		 911 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  29.38 
 
 		 904 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 		 810 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  24.85 
 
 		 892 aa  72  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 		 846 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 907 aa  71.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  28.08 
 
 		 627 aa  71.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2967  GNAT family acetyltransferase  30 
 
 		 809 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  23.49 
 
 		 895 aa  70.9  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 812 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  31.47 
 
 		 893 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 913 aa  68.6  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  24.53 
 
 		 897 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 		 896 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 785 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 		 898 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 806 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 		 898 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 		 813 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4747  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 		 785 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.48 
 
 		 929 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2206  acetyltransferase  27.16 
 
 		 836 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0254612  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 		 785 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0367  acetyltransferase  27.16 
 
 		 787 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00347204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1237  acetyltransferase  27.16 
 
 		 1024 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000574609  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1554  acetyltransferase  27.16 
 
 		 803 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00991343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1742  acetyltransferase  27.16 
 
 		 803 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00130768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2999  acetyltransferase  27.16 
 
 		 803 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000057298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2882  acetyltransferase  27.16 
 
 		 803 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0404  acetyltransferase  27.16 
 
 		 787 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 		 900 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  24.12 
 
 		 918 aa  64.7  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  27.71 
 
 		 903 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5396  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 		 785 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916817  normal  0.647823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.43 
 
 		 892 aa  64.3  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 		 897 aa  64.3  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 		 887 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1436  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  25.17 
 
 		 894 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  26.99 
 
 		 901 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72260  hypothetical protein  25.58 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  24.12 
 
 		 896 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6272  hypothetical protein  25.58 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  29.41 
 
 		 899 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  28.86 
 
 		 911 aa  60.8  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 		 893 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>