More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4874 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4874  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  100 
 
 
398 aa  815    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2142  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  73.51 
 
 
410 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2116  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  72.66 
 
 
410 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0967  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  51.77 
 
 
373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00178187  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1834  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  51.66 
 
 
368 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2209  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  52.21 
 
 
368 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331992  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3529  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  51.66 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318249  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5871  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  52.2 
 
 
375 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3461  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  50.83 
 
 
368 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.571414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4081  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  50.28 
 
 
371 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6497  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  51.52 
 
 
376 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453974  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47300  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  50 
 
 
371 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3718  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  52.46 
 
 
378 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3683  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  50.28 
 
 
369 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3162  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  51.93 
 
 
376 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  0.0318319 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3138  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  49.73 
 
 
376 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3216  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  50.27 
 
 
374 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5190  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  50.69 
 
 
373 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2895  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  50 
 
 
371 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.011056 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5064  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  49.31 
 
 
370 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.761871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0347  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.76 
 
 
369 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26402  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4662  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  49.86 
 
 
369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3066  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  50 
 
 
369 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5301  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  50 
 
 
369 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4967  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  51.9 
 
 
369 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4697  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  47.12 
 
 
372 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.770845 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2055  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  49.04 
 
 
369 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.669948  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000767  2-aminoethylphosphonate:pyruvate aminotransferase  47.83 
 
 
367 aa  350  4e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0812  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  46.15 
 
 
376 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1756  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.76 
 
 
369 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.029748  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0852  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.76 
 
 
369 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2210  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.76 
 
 
369 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0895  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.76 
 
 
369 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102391  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0546  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.39 
 
 
367 aa  346  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000447311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04876  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  47.01 
 
 
400 aa  346  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1899  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.48 
 
 
369 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0485  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.48 
 
 
369 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0582  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.48 
 
 
369 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1052  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  45.66 
 
 
365 aa  345  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3422  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  49.28 
 
 
369 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.157145  normal  0.100623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1876  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  47.11 
 
 
376 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1440  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.82 
 
 
365 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1415  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.82 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.806093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1240  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.82 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1216  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.82 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1218  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.54 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1341  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.82 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0470  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.39 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3966  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  45.48 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1481  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.82 
 
 
365 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0491  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.09 
 
 
367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0472  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  48.09 
 
 
367 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.456541  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1378  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  45.48 
 
 
365 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1241  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.54 
 
 
365 aa  334  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0533  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  47.8 
 
 
367 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0478  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  47.8 
 
 
367 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168987  normal  0.470271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2747  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  45.35 
 
 
368 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3422  2-aminoethylphosphonate/pyruvate transaminase  40.88 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2312  2-aminoethylphosphonate/pyruvate transaminase  46.18 
 
 
368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1165  aminotransferase, class V  39.5 
 
 
363 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7778  aminotransferase class V  36.73 
 
 
383 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1810  class V aminotransferase  37.18 
 
 
355 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00984948  normal  0.0716447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3820  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  35.78 
 
 
363 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154189  normal  0.305313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2233  putative aminotransferase class-V  35.39 
 
 
355 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5997  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  35.11 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.762607  normal  0.379829 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0760  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  35.86 
 
 
355 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1770  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  35.86 
 
 
355 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1053  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  35.86 
 
 
355 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2028  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  35.86 
 
 
355 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0689  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  35.86 
 
 
355 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0778  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  35.86 
 
 
355 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2063  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  35.86 
 
 
355 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.302236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4473  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  34.65 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1910  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  35.67 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4247  aminotransferase, class V  35.41 
 
 
354 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4119  aminotransferase, class V  35.41 
 
 
354 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142749  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  33.42 
 
 
616 aa  189  9e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3533  aminotransferase, class V  34.54 
 
 
354 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1916  aminotransferase, class V  34.38 
 
 
354 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4014  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  34.26 
 
 
354 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3400  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  33.81 
 
 
354 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  31.56 
 
 
356 aa  170  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3872  aminotransferase, class V  30.03 
 
 
371 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1887  Serine--pyruvate transaminase  28.04 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  29.55 
 
 
406 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  28.2 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  27.03 
 
 
413 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  26.72 
 
 
383 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  26.44 
 
 
382 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  29.39 
 
 
384 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  26.47 
 
 
382 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1674  aminotransferase, class V  29.06 
 
 
372 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00211461  normal  0.187219 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0793  aminotransferase class V  25.5 
 
 
347 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  27.51 
 
 
377 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  27.51 
 
 
377 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  27.51 
 
 
377 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  26.57 
 
 
373 aa  99.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  27.22 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  26.36 
 
 
373 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  23.62 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>