12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4846 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4846  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  179  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0233565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1905  GcrA cell cycle regulator  80.39 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0757  hypothetical protein  51.92 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0126  GcrA cell cycle regulator  40 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46225 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0485  global cell cycle regulator GcrA  45.45 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0696  hypothetical protein  40.35 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2440  hypothetical protein  35.19 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0512  GcrA cell cycle regulator  40.58 
 
 		 168 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.711228  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1217  GcrA cell cycle regulator  40 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0641  GcrA cell cycle regulator  41.79 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4917  GcrA cell cycle regulator  40.3 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0400  GcrA cell cycle regulator  45.83 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.800641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>