34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1180 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  76.09 
 
 		 48 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  76.6 
 
 		 49 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  80.43 
 
 		 48 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  80.43 
 
 		 48 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  73.33 
 
 		 48 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  73.33 
 
 		 48 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  76.09 
 
 		 48 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  75.56 
 
 		 48 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  65.22 
 
 		 46 aa  73.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  73.33 
 
 		 48 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  73.91 
 
 		 48 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  71.11 
 
 		 48 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  69.57 
 
 		 48 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0728  hypothetical protein  65.96 
 
 		 52 aa  68.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0682  hypothetical protein  65.96 
 
 		 52 aa  68.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3865  hypothetical protein  66.67 
 
 		 48 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  51.11 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  45.24 
 
 		 51 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  57.14 
 
 		 50 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  44.19 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  44.19 
 
 		 50 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  44.19 
 
 		 50 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  44.19 
 
 		 50 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2653  hypothetical protein  42.55 
 
 		 47 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1501  protein of unknown function DUF1127  40.43 
 
 		 47 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1699  protein of unknown function DUF1127  40.43 
 
 		 47 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2773  hypothetical protein  46.34 
 
 		 124 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573316  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4397  hypothetical protein  51.52 
 
 		 43 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221753 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0075  hypothetical protein  43.18 
 
 		 50 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0044933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  55.88 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2376  protein of unknown function DUF1127  40 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187035  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1572  hypothetical protein  46.81 
 
 		 48 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.572982 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1102  protein of unknown function DUF1127  54.29 
 
 		 65 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>