More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0746 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  100 
 
 		 78 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  96.15 
 
 		 78 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  96.15 
 
 		 78 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  96.15 
 
 		 78 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  88.46 
 
 		 78 aa  135  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  88.46 
 
 		 78 aa  135  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  88.46 
 
 		 78 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  87.18 
 
 		 78 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  79.49 
 
 		 78 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  79.49 
 
 		 78 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  79.49 
 
 		 78 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 78 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 78 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  82.05 
 
 		 79 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  80.77 
 
 		 79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  80.77 
 
 		 78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 79 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 79 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  82.89 
 
 		 77 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  78.21 
 
 		 78 aa  124  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  81.58 
 
 		 77 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  78.21 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  81.58 
 
 		 77 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  81.58 
 
 		 77 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  81.33 
 
 		 79 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  81.33 
 
 		 79 aa  123  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  81.33 
 
 		 79 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  81.33 
 
 		 79 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  81.33 
 
 		 79 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  80.77 
 
 		 79 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  77.92 
 
 		 77 aa  120  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  77.92 
 
 		 77 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  79.73 
 
 		 77 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  76.62 
 
 		 77 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  76.62 
 
 		 78 aa  116  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  74.36 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  80.82 
 
 		 79 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  78.38 
 
 		 78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  79.45 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  73.08 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  70.51 
 
 		 79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  64 
 
 		 78 aa  98.6  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 77 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  68 
 
 		 79 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  96.7  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  97.1  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  96.7  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 78 aa  96.7  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 82 aa  94.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 82 aa  94.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  59.74 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 78 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 79 aa  94.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  65.33 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 79 aa  94  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  67.57 
 
 		 76 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  61.54 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>