16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3005 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3005  BioH protein, putative  100 
 
 		 233 aa  441  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2992  hypothetical protein  31.9 
 
 		 235 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289546  hitchhiker  0.00544099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0028  hypothetical protein  31.3 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0206923 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2540  BioH protein, putative  32.14 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1150  BioH protein, putative  34.58 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0320  BioH protein, putative  35.65 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0331  BioH protein, putative  35.65 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0342  BioH protein, putative  35.65 
 
 		 256 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0046  hypothetical protein  29.61 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2080  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2124  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  32.4 
 
 		 514 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  37.5 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2691  alpha/beta hydrolase fold protein  34.94 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 		 262 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  28.48 
 
 		 363 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>