20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6738 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6738  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  309  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.396339 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6958  hypothetical protein  41.96 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.141426 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2911  hypothetical protein  36.21 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.215137 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6957  hypothetical protein  28.32 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329306  normal  0.232269 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1928  hypothetical protein  34.71 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.344998  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1409  hypothetical protein  35.56 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2903  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.851598  normal  0.0646646 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0893  hypothetical protein  31.85 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4281  hypothetical protein  34.71 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.419018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3531  hypothetical protein  31.76 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_002950  PG0717  putative lipoprotein  29.13 
 
 
367 aa  49.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.129076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3916  hypothetical protein  28.05 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240375  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2124  hypothetical protein  30.86 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0895  hypothetical protein  29.07 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2438  hypothetical protein  23.64 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84671  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1279  hypothetical protein  27.84 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0491  hypothetical protein  26.42 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4930  hypothetical protein  24.79 
 
 
148 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.325685  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2368  hypothetical protein  27.87 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0314  hypothetical protein  31.39 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.285622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>