38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6249 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6249  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 259 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3201  protein of unknown function DUF34  40.43 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.266326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3238  hypothetical protein  34.6 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2212  hypothetical protein  29.52 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0023  hypothetical protein  25.27 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  19.7 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2744  hypothetical protein  24.71 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  28.81 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0343  hypothetical protein  36.62 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1581  hypothetical protein  25.15 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168425 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  19.7 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  19.7 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  19.7 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  19.7 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  19.7 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  19.7 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  27.87 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  24.47 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  27.68 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  28.42 
 
 		 252 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  26.52 
 
 		 252 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5016  hypothetical protein  27.06 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  27.68 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3232  hypothetical protein  22.65 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  19.32 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57740  hypothetical protein  27.06 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3370  hypothetical protein  24.59 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0876  hypothetical protein  26.74 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  21.2 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  21.2 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  21.2 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  22.81 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01899  NIF3  25.42 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.134254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  22.81 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  24.72 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3545  protein of unknown function DUF34  23.98 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630294  normal  0.0213286 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1114  hypothetical protein  22.42 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00602952  normal  0.0178129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  25.52 
 
 		 372 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>