15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5573 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  416  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  45.59 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  37.87 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  35.12 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  34.62 
 
 		 280 aa  87.8  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  31.17 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  29.32 
 
 		 320 aa  71.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  28.79 
 
 		 756 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2021  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1944  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  25.6 
 
 		 767 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0767  hypothetical protein  26.71 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  27.14 
 
 		 343 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1805  hypothetical protein  27.46 
 
 		 379 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  28.46 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.577822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>