13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3648 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3648  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3997  hypothetical protein  30.59 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742169  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0328  hypothetical protein  27.31 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3753  hypothetical protein  37.29 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2455  hypothetical protein  37.29 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3855  hypothetical protein  32.53 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2784  hypothetical protein  35.51 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290619  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2274  hypothetical protein  34.75 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1328  hypothetical protein  33.05 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977322  normal  0.0373251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1443  hypothetical protein  37.7 
 
 
145 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00473  hypothetical protein  33.9 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2492  hypothetical protein  29.85 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000428836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  22.86 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>