17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3643 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  34.57 
 
 
320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  32.39 
 
 
343 aa  111  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0767  hypothetical protein  36.98 
 
 
218 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  32.58 
 
 
280 aa  94.4  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  31.17 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  35.9 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  37.29 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  32.77 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1884  hypothetical protein  36.22 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  31.1 
 
 
756 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  28.4 
 
 
221 aa  67.8  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.577822 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1944  hypothetical protein  35.79 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1805  hypothetical protein  31.36 
 
 
379 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2021  hypothetical protein  34.74 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1765  hypothetical protein  34.41 
 
 
240 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.97626  normal  0.455491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  25.81 
 
 
767 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>