13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2049 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2049  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  919    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1498  hypothetical protein  33.5 
 
 
409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0114368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  30.73 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  31.69 
 
 
450 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  32.37 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  29.38 
 
 
441 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  26.77 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2148  hypothetical protein  30.37 
 
 
447 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0946706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  30.77 
 
 
448 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  28.16 
 
 
444 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  27.7 
 
 
470 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  30.34 
 
 
448 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0037  hypothetical protein  27.86 
 
 
410 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.434886  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>