13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1940 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1940  Cold-shock protein DNA-binding protein  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0879  hypothetical protein  26.1 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0937382  normal  0.312056 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4358  hypothetical protein  25.42 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.707207 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  43.75 
 
 		 1458 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  24.02 
 
 		 1695 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1037 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 1159 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33603  predicted protein  40 
 
 		 590 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.475936  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  36.23 
 
 		 958 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1246 aa  42.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  37.74 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 1038 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42841  predicted protein  31.07 
 
 		 915 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>