16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1648 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1648  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  259  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.563063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0389  hypothetical protein  53.78 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1859  hypothetical protein  31.36 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0713511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2391  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469176  normal  0.286577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5680  hypothetical protein  34.4 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.287697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1731  hypothetical protein  32.46 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0999577  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1011  hypothetical protein  31.67 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3252  hypothetical protein  33.62 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.744419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7104  hypothetical protein  35.04 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0323  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01710  hypothetical protein  29.46 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0608198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4454  hypothetical protein  30.51 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1850  hypothetical protein  31.73 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00373006  normal  0.150652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4455  hypothetical protein  36.62 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4503  hypothetical protein  35.94 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2237  hypothetical protein  42.5 
 
 		 149 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.483595  normal  0.0351044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>