29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1329 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  100 
 
 		 79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  51.9 
 
 		 97 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  41.77 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  42.67 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  40.28 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  47.14 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  41.67 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  41.89 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  36.49 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  33.8 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  40.28 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  40.28 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  41.18 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  41.18 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  40.28 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  25.97 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  34.21 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  33.77 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  36.11 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1403  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1285  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0617  hypothetical protein  36.11 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  34.72 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1993  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558528  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0674  hypothetical protein  30.56 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  33.82 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  32.39 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1848  hypothetical protein  38.64 
 
 		 44 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523443  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0654  hypothetical protein  43.84 
 
 		 99 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.169854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>