15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0767 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0767  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.635785  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1884  hypothetical protein  52.59 
 
 
151 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3643  hypothetical protein  36.98 
 
 
196 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2224  hypothetical protein  29.59 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1361  hypothetical protein  28.27 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1525  hypothetical protein  28.49 
 
 
188 aa  62  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1115  hypothetical protein  29.73 
 
 
183 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5573  hypothetical protein  26.71 
 
 
203 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3388  hypothetical protein  28.1 
 
 
756 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6186  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02159  hypothetical protein  25.2 
 
 
280 aa  53.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5242  hypothetical protein  25.14 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.577822 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06320  hypothetical protein  27.27 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1944  hypothetical protein  32.29 
 
 
191 aa  48.5  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2021  hypothetical protein  31.25 
 
 
191 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2454  hypothetical protein  20.73 
 
 
767 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0594275  normal  0.111085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>