14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  431  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0325  hypothetical protein  53.33 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  43.7 
 
 		 141 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  37.65 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  40.95 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  36.56 
 
 		 282 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  39.17 
 
 		 448 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  40.38 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  37.14 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  31.71 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  32.02 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  36.84 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>