25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  729    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  53.74 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  48.63 
 
 		 341 aa  282  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  51.87 
 
 		 350 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  51.06 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  44.91 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  39.82 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  40.38 
 
 		 337 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  40.18 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  43.08 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  39.45 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  39.18 
 
 		 347 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  39.18 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  38.87 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  38.56 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  39.75 
 
 		 347 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  38.36 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  38.69 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  36.59 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  43.67 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  38.05 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  29.77 
 
 		 362 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20310  predicted protein  30.15 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  22.71 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>