26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0783 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0783  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 247 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3240  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  98.79 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3343  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  97.98 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0940  transcriptional regulator-related protein  90.69 
 
 		 247 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0880  transcriptional regulator, CadC  78.14 
 
 		 247 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3653  transcriptional regulator, CadC  66.8 
 
 		 249 aa  348  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.409424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3459  transcriptional regulator, CadC  65.99 
 
 		 249 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0833  transcriptional regulator, CadC  65.99 
 
 		 249 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3534  transcriptional regulator, CadC  65.59 
 
 		 249 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3438  winged helix family two component response transcriptional regulator  50.8 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2749  putative transcriptional regulator, CadC  50.4 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3632  response regulator receiver protein  48.19 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0885  transcriptional regulator, CadC  46.59 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0883  response regulator receiver protein  45.93 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0760  response regulator receiver protein  44.49 
 
 		 273 aa  211  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0653  hypothetical protein  29.64 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0879  hypothetical protein  29.46 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3244  response regulator receiver protein  26.8 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3347  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.730311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0881  putative transcriptional regulator, CadC  26.29 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0779  response regulator receiver protein  26.8 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0936  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0757  putative transcriptional regulator, CadC  44.44 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0793  putative transcriptional regulator, CadC  25.1 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.790637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  30.77 
 
 		 565 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2671  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.63 
 
 		 243 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>