21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1580 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1580  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.530554  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1586  hypothetical protein  96.98 
 
 
199 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.196957  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1519  hypothetical protein  95.98 
 
 
199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000380714  normal  0.0491707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2854  hypothetical protein  87.18 
 
 
199 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2749  hypothetical protein  81.25 
 
 
198 aa  331  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188485  normal  0.0271892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1714  hypothetical protein  80.73 
 
 
198 aa  328  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0456721  hitchhiker  0.000000514861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2635  hypothetical protein  80.73 
 
 
198 aa  328  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.895876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2670  hypothetical protein  80.21 
 
 
198 aa  328  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2832  hypothetical protein  66.49 
 
 
194 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830995 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1755  hypothetical protein  64.21 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.196459  normal  0.218269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2367  hypothetical protein  63.49 
 
 
196 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406853  normal  0.0535079 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1699  hypothetical protein  59.47 
 
 
193 aa  240  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1526  hypothetical protein  54.92 
 
 
196 aa  207  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  34.26 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  28.46 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4581  hypothetical protein  33.02 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001840  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1798  retinol acyltransferase domain-containing protein  21.97 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.540939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1447  retinol acyltransferase domain-containing protein  21.97 
 
 
240 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3516  retinol acyltransferase domain-containing protein  21.97 
 
 
240 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1693  retinol acyltransferase domain-containing protein  23.39 
 
 
240 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.36742  normal  0.0247076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>