32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_R0001 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_R0001  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0053  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0038  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000704091 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-1  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0953883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0036  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000218585  hitchhiker  0.0000000000151476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0023  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000976194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0004  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177492  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0024  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0007  tRNA-Met  89.61 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0041  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000202293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0048  tRNA-Met  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0043  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50689  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0027  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.800046  normal  0.352894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0040  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0666979  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0039  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10538  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0049  tRNA-Met  87.18 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0021032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0024  tRNA-Met  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000171351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0020  tRNA-Met  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.070977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0005  tRNA-Met  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0016  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000151702  hitchhiker  0.0080631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0031  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0026  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0049  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0060  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0064072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0009  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1239  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09720  tRNA-Met  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000962233  hitchhiker  0.0000117108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0045  tRNA-Met  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000395206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-1  tRNA-Met  90.7 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0047  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921613  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09370  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03520  tRNA-Met  92.11 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>