37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3260 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3260  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
382 aa  783    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  57.89 
 
 
372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  50 
 
 
371 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0860  hypothetical protein  47.41 
 
 
372 aa  345  1e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.350344  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1795  hypothetical protein  47.78 
 
 
376 aa  343  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156742  normal  0.0804022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0868  hypothetical protein  46.2 
 
 
365 aa  299  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.877924  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0030  hypothetical protein  36.84 
 
 
364 aa  229  4e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0729  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 
385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.272999 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  32.12 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2100  aminoglycoside phosphotransferase  34.77 
 
 
382 aa  205  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.624576  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0570  hypothetical protein  30.68 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  30.38 
 
 
384 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1766  putative homoserine kinase type II  30.27 
 
 
359 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3494  aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 
354 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.794585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0339  aminoglycoside phosphotransferase  30.68 
 
 
358 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1518  aminoglycoside phosphotransferase  26.27 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.215036  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0081  hypothetical protein  28.84 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.201712  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0364  hypothetical protein  30.29 
 
 
346 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 
355 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0269  hypothetical protein  30.09 
 
 
354 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0367  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 
356 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7005  aminoglycoside phosphotransferase  27.62 
 
 
348 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000158499  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3807  aminoglycoside phosphotransferase  30.08 
 
 
354 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3627  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0358  aminoglycoside phosphotransferase  29.48 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0356  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0363  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0366  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0333  aminoglycoside phosphotransferase  29.25 
 
 
354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.320004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3610  aminoglycoside phosphotransferase  29.25 
 
 
354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3431  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 
402 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4578  aminoglycoside phosphotransferase  27.86 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000313167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2269  aminoglycoside phosphotransferase  27.03 
 
 
352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  0.0258017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0655  hypothetical protein  27.41 
 
 
361 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07051  hypothetical protein  30.59 
 
 
273 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5808  aminoglycoside phosphotransferase  27.64 
 
 
356 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  23.19 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>