More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_4014 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0684  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0754  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0865  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4415  transposase IS3/IS911 family protein  98.06 
 
 
103 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  98.06 
 
 
103 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  98.06 
 
 
103 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  98.06 
 
 
103 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  98.06 
 
 
103 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  98.06 
 
 
103 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  98.06 
 
 
103 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  98.06 
 
 
103 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  98.06 
 
 
103 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  98.06 
 
 
103 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4250  transposase IS3/IS911 family protein  97.09 
 
 
103 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  97.09 
 
 
103 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0459  transposase IS3/IS911 family protein  97.09 
 
 
103 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 
392 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  95.56 
 
 
392 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  95.56 
 
 
392 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  84.54 
 
 
114 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  84.54 
 
 
114 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  84.54 
 
 
114 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  84.54 
 
 
114 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  84.54 
 
 
114 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  83.33 
 
 
103 aa  164  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  76.77 
 
 
103 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  68.37 
 
 
100 aa  141  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4464  IS3 family transposase orfA  65.66 
 
 
103 aa  140  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0436168  hitchhiker  0.00706078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0304  IS911 transposase orfA  65.66 
 
 
103 aa  140  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122708  hitchhiker  0.00078594 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  69.07 
 
 
100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  64.65 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  0.00000000270737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1100  IS911 transposase orfA  63.11 
 
 
103 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  66.33 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  70.83 
 
 
103 aa  136  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0015  IS911, transposase orfA  66.67 
 
 
101 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  62.14 
 
 
115 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  62.14 
 
 
115 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  65.31 
 
 
100 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  65.31 
 
 
100 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5033  IS911 transposase orfA  62.5 
 
 
104 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  67.68 
 
 
102 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  67.68 
 
 
102 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  67.68 
 
 
102 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  64.65 
 
 
102 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4765  transposase OrfA  67.03 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3842  transposase IS3/IS911 family protein  64.29 
 
 
103 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0277  transposase IS3/IS911 family protein  64.29 
 
 
103 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0739  transposase IS3/IS911 family protein  64.29 
 
 
103 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3351  transposase IS3/IS911 family protein  66.28 
 
 
122 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04145  IS911 protein  63.1 
 
 
90 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3718  transposase IS3/IS911 family protein  63.1 
 
 
88 aa  114  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04109  hypothetical protein  63.1 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4856  IS911, transposase orfA  63.1 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  56.7 
 
 
101 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  56.7 
 
 
101 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  56.7 
 
 
101 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  56.7 
 
 
101 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  56.7 
 
 
101 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  56.7 
 
 
101 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  55.67 
 
 
101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>