110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3253 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1505  nitric oxide reductase subunit B  54.85 
 
 		 756 aa  805    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0794416 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0633  nitric oxide reductase norZ, putative  52.16 
 
 		 762 aa  788    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5055  nitric oxide reductase large subunit  50.27 
 
 		 761 aa  729    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2802  nitric oxide reductase, subunit B  52.16 
 
 		 762 aa  787    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5786  putative nitric-oxide reductase  50.73 
 
 		 748 aa  750    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1813  nitric oxide reductase  52.65 
 
 		 762 aa  783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3720  putative nitric-oxide reductase  51.97 
 
 		 763 aa  767    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1886  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  54.26 
 
 		 774 aa  830    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3167  nitric oxide reductase large subunit  50.61 
 
 		 759 aa  750    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0364  putative nitric-oxide reductase  52.33 
 
 		 761 aa  778    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3089  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  83.05 
 
 		 761 aa  1264    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0963858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0883  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  83.18 
 
 		 761 aa  1261    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0356599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3253  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  100 
 
 		 762 aa  1552    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0846  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  83.44 
 
 		 761 aa  1269    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00975115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0728  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  78 
 
 		 758 aa  1219    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1328  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  52.86 
 
 		 758 aa  812    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126926  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0092  nitric oxide reductase large subunit  47.2 
 
 		 768 aa  706    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2379  putative nitric oxide reductase norZ  52.16 
 
 		 762 aa  788    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2908  putative nitric oxide reductase norZ  52.16 
 
 		 762 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2680  hypothetical protein  52.16 
 
 		 762 aa  784    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2738  hypothetical protein  52.16 
 
 		 762 aa  787    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547207  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1575  nitric oxide reductase large subunit-like protein  51.58 
 
 		 747 aa  756    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.362479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1694  putative nitric oxide reductase norZ  52.16 
 
 		 762 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.732748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0657  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  80.84 
 
 		 763 aa  1247    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3072  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  83.11 
 
 		 761 aa  1272    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.493365  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2413  nitric oxide reductase large subunit-like protein  52.89 
 
 		 744 aa  804    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5200  putative nitric-oxide reductase  55.68 
 
 		 759 aa  798    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4614  nitric oxide reductase large subunit-like protein  50.14 
 
 		 756 aa  725    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0294129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1520  nitric oxide reductase large subunit-like protein  47.57 
 
 		 759 aa  726    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2427  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  46.41 
 
 		 760 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376989  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3848  putative nitric-oxide reductase  51.88 
 
 		 764 aa  747    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1608  hypothetical protein  48.68 
 
 		 746 aa  728    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1004  putative nitric-oxide reductase  56.59 
 
 		 769 aa  825    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3044  putative nitric-oxide reductase  52.3 
 
 		 767 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0283046  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1535  arginyl-tRNA synthetase (arginine--tRNA ligase; ArgRS)  49.2 
 
 		 743 aa  735    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0453039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3822  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  79.89 
 
 		 761 aa  1228    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0625212  hitchhiker  0.000200151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0761  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  81.1 
 
 		 762 aa  1277    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4013  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  53.56 
 
 		 758 aa  806    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.23875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3777  putative nitric-oxide reductase  51.7 
 
 		 763 aa  758    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3860  putative nitric-oxide reductase  51.83 
 
 		 763 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0109  nitric oxide reductase large subunit  48.76 
 
 		 768 aa  702    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.229583  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4126  nitric oxide reductase subunit B  53.56 
 
 		 758 aa  806    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1403  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  45.86 
 
 		 762 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2550  Nitric-oxide reductase  46.12 
 
 		 762 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2454  Nitric-oxide reductase  45.99 
 
 		 762 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2932  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  46.03 
 
 		 758 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1556  Nitric-oxide reductase  40.13 
 
 		 787 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3493  nitric-oxide reductase subunit B  39.78 
 
 		 756 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28590  nitric oxide reductase large subunit  37.12 
 
 		 840 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1569  nitric-oxide reductase subunit B  37.87 
 
 		 783 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1593  nitric-oxide reductase subunit B  37.87 
 
 		 783 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.718907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1539  nitric-oxide reductase subunit B  38.4 
 
 		 783 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0778717  normal  0.182091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3901  nitric oxide reductase  37.5 
 
 		 763 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3986  nitric oxide reductase  37.24 
 
 		 762 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3302  cytochrome c oxidase subunit I  37.97 
 
 		 769 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3178  cytochrome c oxidase, subunit I  37.84 
 
 		 769 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0182  Nitric-oxide reductase  35.42 
 
 		 776 aa  461  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1902  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  35.59 
 
 		 763 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.960689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1980  Nitric-oxide reductase  34.17 
 
 		 762 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0873  Nitric-oxide reductase  34.47 
 
 		 1077 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2162  hypothetical protein  32.62 
 
 		 780 aa  379  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0945  nitric oxide reductase  32.47 
 
 		 773 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33419  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2060  nitric oxide reductase  33.78 
 
 		 773 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2189  hypothetical protein  32.49 
 
 		 780 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0799  nitric oxide reductase  33.38 
 
 		 772 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0547  nitric oxide reductase  33.38 
 
 		 772 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0658  nitric oxide reductase  33.38 
 
 		 772 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.971693  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0351  Nitric-oxide reductase  33.6 
 
 		 748 aa  338  1.9999999999999998e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000483731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0472  Nitric-oxide reductase  31.52 
 
 		 739 aa  337  5.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000690238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0474  nitric oxide reductase  32.66 
 
 		 683 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1965  nitric oxide reductase large subunit  37.27 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.575096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1908  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  27.16 
 
 		 720 aa  194  7e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0286  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  27.25 
 
 		 731 aa  182  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00622687 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0502  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  26.06 
 
 		 734 aa  172  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2401  nitric oxide reductase large subunit-like protein protein  24.59 
 
 		 706 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1248  cytochrome c oxidase subunit I  29.03 
 
 		 457 aa  134  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.883725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3034  Nitric-oxide reductase  27.96 
 
 		 457 aa  134  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2758  nitric-oxide reductase  29.93 
 
 		 452 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0561  nitric-oxide reductase subunit B  27.8 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000153922  normal  0.745832 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3191  cytochrome c oxidase, subunit I  26.57 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6288  nitric-oxide reductase  27.86 
 
 		 448 aa  125  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2598  Nitric-oxide reductase  28.39 
 
 		 460 aa  125  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605151  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1642  Nitric-oxide reductase  27.38 
 
 		 448 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0625  nitric-oxide reductase subunit B  27.93 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4387  nitric-oxide reductase  27.75 
 
 		 448 aa  122  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06830  nitric-oxide reductase subunit B  27.51 
 
 		 465 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0601  nitric-oxide reductase, B subunit  26.79 
 
 		 463 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3184  nitric oxide reductase subunit B  25.62 
 
 		 459 aa  120  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0249  nitric-oxide reductase, large subunit  27.34 
 
 		 449 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2483  cytochrome c oxidase, subunit I  26.64 
 
 		 462 aa  118  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1468  cytochrome c oxidase subunit I  27.41 
 
 		 483 aa  118  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153062 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  27.16 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2400  nitric-oxide reductase, B subunit, putative  27.14 
 
 		 481 aa  115  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1255  nitric-oxide reductase subunit B  26.71 
 
 		 463 aa  114  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2089  nitric-oxide reductase subunit B  26.37 
 
 		 448 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0823  nitric-oxide reductase subunit B  29.02 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1984  nitric-oxide reductase subunit NorB  25.67 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000788431  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0971  nitric-oxide reductase  25.62 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.838471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2118  cytochrome c oxidase, subunit I  25.84 
 
 		 447 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1980  cytochrome c oxidase, subunit I  25.12 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>