20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0768 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  356  8e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  27.5 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  29.82 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  28.34 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  26.7 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  25.71 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  28.47 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  24.71 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  28.67 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  23.84 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  24.14 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  22.49 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  24.4 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  27.88 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  22.22 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  26.53 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  22.37 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  22.92 
 
 		 199 aa  44.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  25.93 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  20.79 
 
 		 185 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>