27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0772 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0772  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  420  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0759  hypothetical protein  99.02 
 
 
204 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0712  putative cytoplasmic protein  98.53 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.995963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0698  putative cytoplasmic protein  97.55 
 
 
204 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0735  hypothetical protein  62.75 
 
 
235 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.622505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00614  hypothetical protein  62.25 
 
 
235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00603  hypothetical protein  62.25 
 
 
235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0666  hypothetical protein  61.27 
 
 
235 aa  261  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.40885  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2981  protein of unknown function DUF1266  60.78 
 
 
235 aa  261  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3000  hypothetical protein  60.78 
 
 
235 aa  261  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0673  hypothetical protein  59.8 
 
 
235 aa  254  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0676  hypothetical protein  60.29 
 
 
235 aa  254  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0669  hypothetical protein  59.8 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0738  hypothetical protein  59.8 
 
 
235 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.691398 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2978  protein of unknown function DUF1266  59.31 
 
 
235 aa  250  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  59.31 
 
 
231 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  59.31 
 
 
231 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2997  hypothetical protein  59.31 
 
 
235 aa  250  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  59.31 
 
 
231 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0761  hypothetical protein  59.31 
 
 
231 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.538719  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1884  hypothetical protein  38.34 
 
 
231 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4188  hypothetical protein  34.69 
 
 
234 aa  127  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4473  protein of unknown function DUF1266  34.18 
 
 
234 aa  124  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.979526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1395  hypothetical protein  22.95 
 
 
242 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.560951  normal  0.646093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2503  hypothetical protein  26.86 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.148433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4553  hypothetical protein  26.32 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896381  decreased coverage  0.00517061 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0603  hypothetical protein  48.65 
 
 
37 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>