21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1654 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1654  isoflavone reductase  100 
 
 
309 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0467519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1864  isoflavone reductase  98.71 
 
 
309 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1472  isoflavone reductase  98.38 
 
 
309 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1803  isoflavone reductase  97.73 
 
 
309 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1802  isoflavone reductase  97.73 
 
 
309 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  0.0109972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3806  NmrA family protein  53.85 
 
 
309 aa  308  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3617  NmrA family protein  53.51 
 
 
309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.392591  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0801  putative isoflavone oxidoreductase  47.99 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  46.98 
 
 
310 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  46.08 
 
 
312 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0184  NmrA family protein  40.65 
 
 
317 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2406  NmrA-like  42.28 
 
 
313 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4834  NmrA family protein  40.97 
 
 
317 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.596306 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6810  NmrA family protein  40.72 
 
 
317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4574  NmrA family protein  40 
 
 
317 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136155 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05317  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00280)  37.67 
 
 
280 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262337  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08968  isoflavone reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12510)  22.27 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547288  normal  0.861048 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  24.26 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02430  conserved hypothetical protein  24.71 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000237678  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  23.12 
 
 
344 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  33.94 
 
 
454 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>