50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1420 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1083  phage minor tail protein L  99.57 
 
 		 231 aa  480  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1155  phage minor tail protein L  100 
 
 		 231 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1420  phage minor tail protein L  100 
 
 		 231 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0336216 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2106  phage minor tail protein L  67.1 
 
 		 232 aa  344  6e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000127326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1635  phage minor tail protein L  67.1 
 
 		 232 aa  344  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00747  hypothetical protein  66.67 
 
 		 232 aa  343  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10051  tail component  66.67 
 
 		 232 aa  343  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1200  phage minor tail protein L  66.67 
 
 		 232 aa  340  8e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764966 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1469  phage minor tail protein L  65.8 
 
 		 232 aa  339  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3192  phage minor tail protein L  67.1 
 
 		 232 aa  338  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000040598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1874  phage minor tail protein L  67.1 
 
 		 232 aa  338  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.108794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0910  phage minor tail protein L  65.8 
 
 		 232 aa  338  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1197  phage minor tail protein L  67.1 
 
 		 232 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1798  phage minor tail protein L  67.1 
 
 		 232 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0535424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2766  phage minor tail protein L  67.1 
 
 		 232 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1551  phage minor tail protein L  67.1 
 
 		 232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120682  hitchhiker  0.00403336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1090  phage minor tail protein L  66.67 
 
 		 232 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.555696  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3124  phage minor tail protein L  66.67 
 
 		 232 aa  333  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0393909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2171  phage minor tail protein L  65.8 
 
 		 232 aa  331  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0883  phage minor tail protein L  65.8 
 
 		 232 aa  330  9e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2799  phage minor tail protein L  63.2 
 
 		 232 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145975  normal  0.513546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0705  phage minor tail protein L  63.2 
 
 		 232 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0661  phage minor tail protein L  47.91 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000371871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2235  minor tail protein  69.35 
 
 		 145 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108379 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3879  phage minor tail protein L  38.46 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.533723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3385  phage minor tail protein L  37.44 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126204  hitchhiker  0.0000000000973019 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1691  phage minor tail protein L  35.51 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1059  phage minor tail protein L  35.51 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0091  phage minor tail protein L  35.27 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2949  prophage LambdaSo, minor tail protein L  34.76 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3099  phage minor tail protein L  40.12 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.221958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08260  putative minor tail protein L  32.87 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2384  phage minor tail protein L  40.12 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1694  phage HK022 GP18-like protein  32.75 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235763  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0782  phage minor tail protein L  32.41 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2579  phage minor tail protein L  33.05 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3931  phage minor tail protein L  30.83 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0446  phage minor tail protein  33.97 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2778  Phage minor tail protein L  34.55 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0268125  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2223  phage minor tail protein L  31.25 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2419  phage minor tail protein L  31.25 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5050  phage minor tail protein L  30.62 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4060  phage minor tail protein L  29.86 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5753  phage minor tail protein L  30.14 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7021  phage minor tail protein L  29.86 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3879  phage minor tail protein L  30.14 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3530  phage minor tail protein L  29.38 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6225  phage minor tail protein L  28.91 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1891  Phage-related protein-like  23.65 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3496  hypothetical protein  22.15 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>