19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2357 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2357  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  213  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.532778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3309  hypothetical protein  47.83 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  46.67 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3078  hypothetical protein  48.19 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.963714  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1312  hypothetical protein  48.19 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234542  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1279  hypothetical protein  48.19 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1235  hypothetical protein  48.19 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  48.78 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  48.78 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  42.16 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  41.3 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3408  hypothetical protein  46.34 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2729  hypothetical protein  47.95 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4432  hypothetical protein  30.21 
 
 
108 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4292  hypothetical protein  29.79 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0108  hypothetical protein  29.79 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1238  hypothetical protein  33.75 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0278337  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3411  hypothetical protein  34.09 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.031686  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  27.71 
 
 
109 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.127527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>