16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0028 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0028  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.29937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0631  hypothetical protein  43.06 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000769552  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3125  hypothetical protein  36.32 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2787  hypothetical protein  37 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1957  hypothetical protein  37.86 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0559191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0839  hypothetical protein  38.58 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2233  hypothetical protein  37.02 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.294656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2920  hypothetical protein  34.36 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2228  hypothetical protein  34.67 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1912  hypothetical protein  33.49 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3265  hypothetical protein  34.8 
 
 		 229 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2387  hypothetical protein  27.6 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0136297  normal  0.0170325 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0943  hypothetical protein  32.81 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.056929  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6222  hypothetical protein  32.81 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2699  hypothetical protein  32.08 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02255  hypothetical protein  23 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>