30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0504 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  100 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  99.32 
 
 		 292 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  99.32 
 
 		 292 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  98.63 
 
 		 292 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  75.68 
 
 		 292 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  75.68 
 
 		 292 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  73.97 
 
 		 292 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  73.97 
 
 		 292 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  73.63 
 
 		 292 aa  447  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  58.16 
 
 		 304 aa  345  7e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  56.7 
 
 		 301 aa  322  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  55.33 
 
 		 293 aa  316  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  52.63 
 
 		 289 aa  295  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  50.85 
 
 		 292 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  50.52 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  49.48 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  32.81 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  29.6 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  35.71 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  29.44 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  27.15 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  26.11 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0760  hypothetical protein  28.38 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0373973  normal  0.392235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  27.78 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  28.25 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  25.4 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  27.22 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  24.48 
 
 		 482 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  25.6 
 
 		 481 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  20.9 
 
 		 553 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>