39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1451 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  100 
 
 		 99 aa  200  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  96.97 
 
 		 145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  94.95 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  93.94 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  93.94 
 
 		 145 aa  190  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  53.92 
 
 		 157 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  52.94 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  53.47 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  52.94 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  52.48 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  52.48 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  52.48 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  52.48 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  51.96 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  52.48 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  51.49 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  51.52 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  51.52 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  50.51 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  50.51 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  50.51 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  49.5 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  49.49 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  49.5 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  49.5 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  48.48 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  48.48 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  49 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  47 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  45.1 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  43.56 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  44.66 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  47.57 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  42.72 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  40.66 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  41.75 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1744  lysis protein  35.42 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  37.5 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  37.5 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>