50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1090 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1090  phage minor tail protein L  100 
 
 		 232 aa  482  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.555696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0883  phage minor tail protein L  98.28 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2171  phage minor tail protein L  93.97 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2766  phage minor tail protein L  92.67 
 
 		 232 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1798  phage minor tail protein L  92.67 
 
 		 232 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0535424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1197  phage minor tail protein L  92.67 
 
 		 232 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3192  phage minor tail protein L  92.24 
 
 		 232 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000040598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3124  phage minor tail protein L  93.1 
 
 		 232 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0393909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1874  phage minor tail protein L  92.24 
 
 		 232 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.108794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1551  phage minor tail protein L  92.67 
 
 		 232 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120682  hitchhiker  0.00403336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2106  phage minor tail protein L  76.29 
 
 		 232 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000127326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1200  phage minor tail protein L  75.86 
 
 		 232 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764966 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10051  tail component  75.86 
 
 		 232 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1635  phage minor tail protein L  76.29 
 
 		 232 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00747  hypothetical protein  75.86 
 
 		 232 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1469  phage minor tail protein L  75.43 
 
 		 232 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0910  phage minor tail protein L  75.86 
 
 		 232 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2799  phage minor tail protein L  75.43 
 
 		 232 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145975  normal  0.513546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0705  phage minor tail protein L  75.43 
 
 		 232 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1083  phage minor tail protein L  66.67 
 
 		 231 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1155  phage minor tail protein L  66.67 
 
 		 231 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1420  phage minor tail protein L  66.67 
 
 		 231 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0336216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2235  minor tail protein  94.21 
 
 		 145 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0661  phage minor tail protein L  43.72 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000371871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3879  phage minor tail protein L  40.62 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.533723 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1691  phage minor tail protein L  38.39 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1059  phage minor tail protein L  38.39 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0091  phage minor tail protein L  40.93 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3385  phage minor tail protein L  39.52 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126204  hitchhiker  0.0000000000973019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08260  putative minor tail protein L  35.65 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0782  phage minor tail protein L  35.19 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1694  phage HK022 GP18-like protein  37.44 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235763  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3099  phage minor tail protein L  38.59 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.221958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2949  prophage LambdaSo, minor tail protein L  35.29 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3931  phage minor tail protein L  37.5 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2579  phage minor tail protein L  35.29 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2384  phage minor tail protein L  36.96 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2778  Phage minor tail protein L  36.46 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0268125  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2419  phage minor tail protein L  31.85 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0446  phage minor tail protein  33 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2223  phage minor tail protein L  32.61 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5753  phage minor tail protein L  28.19 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3879  phage minor tail protein L  28.19 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5050  phage minor tail protein L  28.19 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3530  phage minor tail protein L  28.32 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7021  phage minor tail protein L  27.88 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4060  phage minor tail protein L  27.43 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6225  phage minor tail protein L  26.99 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1891  Phage-related protein-like  29.72 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0777557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3496  hypothetical protein  25.49 
 
 		 175 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>