48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0784 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0784  PAP2 family protein  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1483  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  98.31 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2323  PAP2 family protein  98.31 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.00704266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3312  PAP2 family protein  98.31 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  0.0360281 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2472  PAP2 family protein  98.31 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02104  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  97.47 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1473  phosphoesterase PA-phosphatase related  97.47 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000602419  hitchhiker  0.00323663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2312  PAP2 family protein  97.47 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.503655  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02063  hypothetical protein  97.47 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2453  inner membrane protein YeiU  82.17 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00121295  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2450  hypothetical protein  82.17 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  hitchhiker  0.0000000794729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2564  inner membrane protein YeiU  82.17 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00168101  hitchhiker  0.0000332566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2362  inner membrane protein YeiU  81.74 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000283776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2407  inner membrane protein YeiU  81.74 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000750111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2770  phosphoesterase, PA-phosphatase related  72.27 
 
 		 240 aa  344  7e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3242  phosphoesterase PA-phosphatase related  61.74 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  60.87 
 
 		 233 aa  292  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.797706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1647  phosphoesterase PA-phosphatase related  61.95 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1502  hypothetical protein  61.9 
 
 		 233 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  60.26 
 
 		 234 aa  284  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2706  PAP2 family protein  61.47 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2783  phosphoesterase PA-phosphatase related  61.47 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0690  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.27 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0266  hypothetical protein  29.24 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5938  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4961  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.19 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000885099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68620  hypothetical protein  29.44 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0276  phosphoesterase PA-phosphatase related  25 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0266  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.27 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0366  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.45 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0251  hypothetical protein  25.93 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  25 
 
 		 565 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.14 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.14 
 
 		 202 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.14 
 
 		 202 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.14 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.57 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0407  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.15 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.85 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6062  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.66 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0884103 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.08 
 
 		 199 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 		 198 aa  42  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 		 198 aa  42  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 		 198 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 		 198 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  33.33 
 
 		 198 aa  42  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 		 198 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>