32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0276 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0276  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0266  phosphoesterase, PA-phosphatase related  92.8 
 
 		 264 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0251  hypothetical protein  91.29 
 
 		 264 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4961  phosphoesterase PA-phosphatase related  87.88 
 
 		 264 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000885099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0266  hypothetical protein  67.3 
 
 		 266 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68620  hypothetical protein  60.23 
 
 		 267 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5938  hypothetical protein  59.85 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0366  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.44 
 
 		 264 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.25 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.797706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3242  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.41 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1647  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.08 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2706  PAP2 family protein  28.1 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2783  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.1 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0690  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.51 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1502  hypothetical protein  27.62 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02104  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.11 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02063  hypothetical protein  27.11 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1473  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.11 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000602419  hitchhiker  0.00323663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2312  PAP2 family protein  27.11 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.503655  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0784  PAP2 family protein  25.88 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2472  PAP2 family protein  25.88 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2323  PAP2 family protein  25.88 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.00704266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1483  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.88 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3312  PAP2 family protein  25.88 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  0.0360281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2770  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.96 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2407  inner membrane protein YeiU  27.06 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000750111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2362  inner membrane protein YeiU  27.06 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000283776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2564  inner membrane protein YeiU  27.06 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00168101  hitchhiker  0.0000332566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2450  hypothetical protein  26.61 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  hitchhiker  0.0000000794729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2453  inner membrane protein YeiU  26.61 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00121295  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.05 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  26.84 
 
 		 565 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>