53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2706 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2783  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1502  hypothetical protein  99.57 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2706  PAP2 family protein  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3242  phosphoesterase PA-phosphatase related  73.82 
 
 		 234 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1647  phosphoesterase PA-phosphatase related  72.29 
 
 		 233 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  71.49 
 
 		 233 aa  333  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.797706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1483  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  61.9 
 
 		 237 aa  299  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2323  PAP2 family protein  61.9 
 
 		 237 aa  299  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.00704266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2472  PAP2 family protein  61.9 
 
 		 237 aa  299  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3312  PAP2 family protein  61.9 
 
 		 237 aa  299  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  0.0360281 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  63.09 
 
 		 234 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0784  PAP2 family protein  61.47 
 
 		 249 aa  298  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02104  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.04 
 
 		 237 aa  296  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1473  phosphoesterase PA-phosphatase related  61.04 
 
 		 237 aa  296  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000602419  hitchhiker  0.00323663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2312  PAP2 family protein  61.04 
 
 		 237 aa  296  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.503655  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02063  hypothetical protein  61.04 
 
 		 237 aa  296  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2362  inner membrane protein YeiU  61.64 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000283776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2453  inner membrane protein YeiU  61.64 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00121295  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2450  hypothetical protein  61.64 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  hitchhiker  0.0000000794729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2407  inner membrane protein YeiU  61.64 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000750111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2770  phosphoesterase, PA-phosphatase related  62.45 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2564  inner membrane protein YeiU  61.21 
 
 		 248 aa  284  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00168101  hitchhiker  0.0000332566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0690  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.21 
 
 		 236 aa  148  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0266  hypothetical protein  30.09 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68620  hypothetical protein  29.41 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5938  hypothetical protein  31.5 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0276  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.72 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0251  hypothetical protein  28.51 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0266  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.05 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4961  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.27 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000885099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0366  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.89 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  27.46 
 
 		 565 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.41 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.41 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.41 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.4 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.41 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.09 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.09 
 
 		 198 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.2 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  25.2 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.09 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.2 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.09 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.2 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  25.2 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6467  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.38 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9009  hypothetical protein  22.93 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.66 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.66 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.66 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  27.66 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>