13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3239 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3239  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  826    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  26.42 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  26.79 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  26.59 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1589  hypothetical protein  23.85 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  25.18 
 
 
422 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  23.34 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  27.54 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4908  hypothetical protein  25.16 
 
 
366 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.061778  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3377  hypothetical protein  28.14 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.718952  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  24.92 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  28.21 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  28.05 
 
 
399 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>