12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4683 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4683  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 418 aa  807    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.305747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4253  Pyrrolo-quinoline quinone  76.32 
 
 		 418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.240609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  33.02 
 
 		 585 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.81 
 
 		 385 aa  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.53 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.6 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4255  hypothetical protein  31.32 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0105879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  31.13 
 
 		 613 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  30.19 
 
 		 612 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 		 687 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.25 
 
 		 386 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  29.09 
 
 		 901 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>