12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4398 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4017  hypothetical protein  83.09 
 
 
605 aa  1008    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4398  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1215    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6300  calcineurin-like phosphoesterase family protein  44.92 
 
 
549 aa  442  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1254  hypothetical protein  36.02 
 
 
680 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3941  hypothetical protein  36.01 
 
 
579 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3190  hypothetical protein  33.5 
 
 
661 aa  267  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2179  hypothetical protein  32.51 
 
 
590 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.92082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2336  hypothetical protein  32.51 
 
 
590 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1802  hypothetical protein  29.27 
 
 
828 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6679  hypothetical protein  27.12 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207997  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1801  metallophosphoesterase  25 
 
 
517 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.050773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1163  metallophosphoesterase  25.58 
 
 
696 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>