18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4044 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4044  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345099  normal  0.110238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3667  hypothetical protein  84.13 
 
 
63 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  36.21 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3625  hypothetical protein  31.58 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  29.63 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1064  hypothetical protein  35.19 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1279  hypothetical protein  30.19 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157817  normal  0.180796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  29.09 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  30 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  32.2 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  32.2 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5253  hypothetical protein  29.09 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0436617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  32.2 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  29.09 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  32.14 
 
 
77 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  28.81 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  30.51 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  30.51 
 
 
99 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>