14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2459 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2459  restriction endonuclease  100 
 
 		 267 aa  550  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0102713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3510  restriction endonuclease  35.29 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2604  restriction endonuclease  29.81 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2536  hypothetical protein  29.82 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584503  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6910  hypothetical protein  27.83 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2490  hypothetical protein  39.19 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  30 
 
 		 911 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1811  hypothetical protein  25.47 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1870  hypothetical protein  32.04 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0179  hypothetical protein  30.43 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0226  hypothetical protein  29.11 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481584  normal  0.43543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  25.79 
 
 		 314 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>